Μικροβιολογία Εδάφους

Θεωρία

1.Εισαγωγή-Η σημασία των μικροοργανισμών στο εδαφικό περιβάλλον. Οι μικροοργανισμοί του εδάφους.

2.Οικολογία μικροβιακών πληθυσμών στο έδαφος-Οικολογικές κατηγορίες αλληλεπιδράσεων μικροβιακών κοινοτήτων εδάφους.

3.Μέθοδοι προσδιορισμού και ανάλυσης μικροβιακής ποικιλότητας στο έδαφος.

4.Επισκόπηση μικροβιακού μεταβολισμού.

5.Ο μεταβολισμός του αζώτου στο έδαφος (αμμωνιοποίηση, νιτροποίηση απονιτροποίηση), Συμβιωτική και μη-συμβιωτική αζωτοδέσμευση.

6.Ο μεταβολισμός του θείου, φωσφόρου, σιδήρου κλπ.

7.Ριζόσφαιρα και σπερμόσφαιρα. Παραγωγή και εφαρμογές μικροβιακών εμβολίων.

8.Αλληλεπιδράσεις φυτών και εδαφικών μικροοργανισμών, συμβιωτικά και μη-συμβιωτικά βακτήρια, βιολογική καταπολέμηση εδαφογενών παθογόνων.

9.Συμβιωτικοί και σαπροτροφικοί μύκητες – Μυκόρριζες.

10.Ανίχνευση μικροοργανισμών σε γεωργικά ενδιαιτήματα.

11.Μεταβολισμός ξενοβιοτικών ενώσεων στο έδαφος, βιοαποκατάσταση επιβαρυμένων εδαφών.

12.Παραγωγή οργανικών εδαφοβελτιωτικών.

13.Μικροβιολογία υποβαθμισμένων εδαφών - Αναβάθμιση υποβαθμισμένων εδαφών.

Εργαστήριο

1.Μελέτη των μικροβιακών κοινοτήτων στο έδαφος με άμεση μικροσκοπική παρατήρηση (contact slide assay)

2.O ρόλος των μικροοργανισμών στο σχηματισμό των εδαφικών συσσωματωμάτων

3.Η μέθοδος των διαδοχικών αραιώσεων για την απομόνωση και απαρίθμηση των μικροβιακών πληθυσμών του εδάφους (Dilution plates)

4.Η μέθοδος του πλέον πιθανού αριθμού για την εκτίμηση του μεγέθους των ελεύθερα διαβιούντων αζωτοδεσμευτικών πληθυσμών του εδάφους (MostProbable Number).

5. Απομόνωση γενωμικού DNAαπό εδαφικά δείγματα και εφαρμογές.

6.Μυκόρριζες (αλληλεπιδράσεις ριζικού συστήματος φυτών και μικροοργανισμών).